При эндогенном пути развития заболевание чаще всего бывает следствием реактивации очагов, которые остались после первичного инфицирования. К последним относят очаги Симона Ашоф-Пуля и Абрикосова. Способствовать реактивации указанных остаточных легочных изменений могут различные факторы, среди которых важнейшими являются изнурительные болезни, травмы, грубые нарушения режима питания, изменение климатической зоны, профессиональные воздействия. 

Особое значение придается приведенным выше факторам, когда их проявления совпадают с периодом полового созревания. Кроме этого, при проведении дифференциальной диагностики учитывается принадлежность больного к группам риска. Среди таковых необходимо назвать хронические заболевания легких неспецифического характера, хронический бронхит, сахарный диабет, длительное употребление гормонов, цитостатиков, беременность, тяжелые оперативные вмешательства. Приведенное необходимо вдумчиво учитывать при верификации болезни. Следует отметить, что это в ряде случаев сможет помочь установить истину. 

Итак, диагностика туберкулезного процесса начинается задолго до изучения врачом больного и болезни. Чтобы подтвердить роль приведенных факторов в патогенезе очагового туберкулеза следует отметить, что для развития туберкулезной гранулемы, то есть туберкулезного бугорка, который является элементарной специфической долькой туберкулезного воспаления, достаточно 10 микобактерий. Понятно, что это очень мало. К тому же на этом этапе процесс может остановиться. В то же время для образования туберкулезного очага необходимо уже 6-10 микобактерий туберкулеза. Разница довольно существенная.

При эндогенном патогенезе очагового туберкулеза последний может быть результатом обратного развития больших по распространенности процессов, а именно: инфильтративного, диссеминированного или даже фиброзно-кавернозного. Но при таком патогенезе диагностических трудностей при очаговом процессе бывает меньше. И нужно помнить, что при инволюции указанных процессов возможны другие трудности. Следующим диагностическим этапом при очаговом процессе является изучение клинических признаков болезни и ее течение.

Диагностический период туберкулеза может затягиваться на многие месяцы, а нередко годы. За это время пациент, выделяя значительное количество микобактерий в окружающую среду, заражает за 1 год 20-25 человек.